MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	CTCAAG	2	12	91595	91606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_002679	GC	3	6	91615	91620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_002679	CCG	2	6	91685	91690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_002679	ACG	2	6	91737	91742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_002679	CCAA	2	8	91874	91881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_002679	AAC	2	6	91889	91894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_002679	TGC	2	6	91918	91923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_002679	AGT	2	6	92030	92035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_002679	GGA	2	6	92073	92078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002679	AG	4	8	95453	95460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002679	AGAC	2	8	95535	95542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_002679	CGACG	2	10	95624	95633	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
513	NC_002679	A	6	6	95665	95670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002679	CTATTG	2	12	95898	95909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_002679	GA	3	6	95915	95920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_002679	AAG	2	6	95944	95949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_002679	CGA	2	6	96016	96021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002679	ATC	2	6	96051	96056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_002679	AG	3	6	96062	96067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002679	TAT	2	6	96109	96114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002679	GAG	2	6	97418	97423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002679	AG	3	6	97422	97427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_002679	ATC	2	6	98382	98387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002679	CGT	2	6	98395	98400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_002679	ACG	2	6	98429	98434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_002679	TCC	2	6	98499	98504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_002679	CG	3	6	98522	98527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_002679	TCGGT	2	10	98589	98598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
529	NC_002679	GGC	2	6	98609	98614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_002679	TGC	2	6	98643	98648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002679	GTT	2	6	98651	98656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002679	GTG	2	6	98792	98797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002679	CTG	2	6	98825	98830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002679	GGC	2	6	98891	98896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002679	TGAT	2	8	99449	99456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002679	TCC	2	6	100837	100842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_002679	ACTT	2	8	100870	100877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_002679	GT	3	6	100885	100890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_002679	CGA	2	6	100959	100964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002679	GTG	2	6	100975	100980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002679	CCCT	2	8	101046	101053	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
542	NC_002679	TCCT	2	8	101094	101101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002679	GCC	2	6	101156	101161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_002679	CAAT	2	8	101230	101237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_002679	GAA	2	6	101313	101318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_002679	ATGGCA	2	12	101509	101520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
547	NC_002679	ACAT	2	8	101600	101607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_002679	CAT	3	9	101633	101641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_002679	CG	3	6	101661	101666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_002679	CTT	2	6	101667	101672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002679	GCT	2	6	101731	101736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_002679	AAC	2	6	101744	101749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_002679	TAT	2	6	101825	101830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002679	CAT	2	6	101905	101910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_002679	CGC	2	6	105001	105006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_002679	CGC	2	6	105182	105187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_002679	TTTC	2	8	105188	105195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_002679	TCC	2	6	105231	105236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_002679	CGA	2	6	105259	105264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002679	TCT	2	6	105267	105272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002679	CAT	2	6	105405	105410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_002679	CGA	2	6	105434	105439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002679	CTT	2	6	105447	105452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002679	CGG	2	6	105617	105622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_002679	CAC	2	6	105963	105968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_002679	TTCAT	2	10	107952	107961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_002679	CAG	2	6	107992	107997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_002679	CGG	2	6	108127	108132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_002679	CGG	2	6	108134	108139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_002679	CAT	2	6	108177	108182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002679	GA	3	6	108202	108207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002679	ATCG	2	8	108246	108253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_002679	GCG	2	6	108257	108262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002679	CGA	2	6	108318	108323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_002679	GGCA	2	8	108330	108337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
576	NC_002679	CCT	2	6	108343	108348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_002679	CCG	2	6	108349	108354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_002679	TGC	2	6	108451	108456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_002679	GCG	2	6	108511	108516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002679	TAT	2	6	108526	108531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002679	ACT	2	6	108534	108539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002679	ACGC	2	8	108561	108568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
583	NC_002679	TAA	2	6	108605	108610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002679	TCC	2	6	108655	108660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_002679	TTG	2	6	108685	108690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002679	AGCG	2	8	108711	108718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_002679	GCC	2	6	108747	108752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_002679	CGA	2	6	109912	109917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_002679	CGG	2	6	109931	109936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002679	CAT	2	6	109937	109942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002679	GGC	2	6	109969	109974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_002679	GC	3	6	109998	110003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_002679	GCA	2	6	110050	110055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002679	AT	3	6	110079	110084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002679	CGT	2	6	110092	110097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_002679	GAG	2	6	110105	110110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002679	AAG	2	6	115380	115385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_002679	ACA	2	6	115405	115410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_002679	AGC	2	6	115425	115430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_002679	GTC	2	6	117260	117265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_002679	TGGC	2	8	117269	117276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_002679	TGA	2	6	117325	117330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002679	CGC	2	6	117412	117417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_002679	CTGC	2	8	120012	120019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_002679	CGC	2	6	120051	120056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_002679	GCC	2	6	120060	120065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_002679	CGC	2	6	120084	120089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_002679	GAC	2	6	120158	120163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_002679	CCG	2	6	120178	120183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_002679	ACA	2	6	120189	120194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_002679	TCGT	2	8	120215	120222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_002679	GA	3	6	121510	121515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_002679	T	6	6	121548	121553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002679	TGAA	2	8	121560	121567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002679	T	7	7	121569	121575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_002679	AAC	2	6	121587	121592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_002679	AAC	2	6	121630	121635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_002679	GCGCG	2	10	121658	121667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
619	NC_002679	ACA	2	6	121734	121739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002679	GA	3	6	121808	121813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002679	CACT	2	8	121875	121882	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_002679	GACC	2	8	121904	121911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_002679	CAC	2	6	121926	121931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_002679	TCC	2	6	121996	122001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_002679	TAG	2	6	122050	122055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002679	TGC	2	6	122059	122064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_002679	CCA	2	6	122159	122164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_002679	CGA	2	6	122174	122179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_002679	TGA	2	6	122195	122200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_002679	TCC	2	6	122209	122214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_002679	GGC	2	6	122225	122230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_002679	TCG	2	6	122329	122334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_002679	TG	3	6	122357	122362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_002679	A	6	6	122425	122430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_002679	GAG	2	6	122444	122449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_002679	GCC	2	6	124756	124761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_002679	ACGA	2	8	130419	130426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_002679	CGG	2	6	134583	134588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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